TY - JOUR AU - Haga, S. B. AU - Beskow, L. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Ethical, legal, and social implications of biobanks for genetics research JO - Adv Genet VL - 60 ID - Haga2008 ER - TY - JOUR AU - Tuck, M. K. AU - Chan, D. W. AU - Chia, D. AU - Godwin, A. K. AU - Grizzle, W. E. AU - Krueger, K. E. AU - Rom, W. AU - Sanda, M. AU - Sorbara, L. AU - Stass, S. AU - Wang, W. AU - Brenner, D. E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Standard operating procedures for serum and plasma collection: early detection research network consensus statement standard operating procedure integration working group JO - J Proteome Res VL - 8 UR - https://doi.org/10.1021/pr800545q DO - 10.1021/pr800545q ID - Tuck2009 ER - TY - JOUR AU - Macleod, A. K. AU - Liewald, D. C. M. AU - McGilchrist, M. M. AU - Morris, A. D. AU - Kerr, S. M. AU - Porteous, D. J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Some principles and practices of genetic biobanking studies JO - Eur Respir J VL - 33 UR - https://doi.org/10.1183/09031936.00043508 DO - 10.1183/09031936.00043508 ID - Macleod2009 ER - TY - STD TI - https://www.nds.ox.ac.uk/research/quod. UR - https://www.nds.ox.ac.uk/research/quod ID - ref4 ER - TY - JOUR AU - Sylte, M. S. AU - Wentzel-Larsen, T. AU - Bolann, B. J. PY - 2013 DA - 2013// TI - Random variation and systematic error caused by various preanalytical variables, estimated by linear mixed-effects models JO - Clin Chim Acta VL - 415 UR - https://doi.org/10.1016/j.cca.2012.10.045 DO - 10.1016/j.cca.2012.10.045 ID - Sylte2013 ER - TY - JOUR AU - Jezequel-Cuer, M. AU - Moël, G. AU - Covi, G. AU - Lepage, S. AU - Peynet, J. AU - Gousson-Evstigneeff, T. AU - Laureaux, C. AU - Troupel, S. PY - 1994 DA - 1994// TI - Stability of alpha-tocopherol: pre-analytical conditions in its determination in blood samples JO - Ann Biol Clin (Paris) VL - 52 ID - Jezequel-Cuer1994 ER - TY - JOUR AU - Janssen, K. AU - Delanghe, J. PY - 2010 DA - 2010// TI - Importance of the pre-analytical phase in blood glucose analysis JO - Acta Clin Belg VL - 65 UR - https://doi.org/10.1179/acb.2010.068 DO - 10.1179/acb.2010.068 ID - Janssen2010 ER - TY - JOUR AU - Zhao, X. AU - Qureshi, F. AU - Eastman, P. S. AU - Manning, W. C. AU - Alexander, C. AU - Robinson, W. H. AU - Hesterberg, L. K. PY - 2012 DA - 2012// TI - Pre-analytical effects of blood sampling and handling in quantitative immunoassays for rheumatoid arthritis JO - J Immunol Methods VL - 378 UR - https://doi.org/10.1016/j.jim.2012.02.007 DO - 10.1016/j.jim.2012.02.007 ID - Zhao2012 ER - TY - JOUR AU - Watt, A. D. AU - Perez, K. A. AU - Rembach, A. R. AU - Masters, C. L. AU - Villemagne, V. L. AU - Barnham, K. J. PY - 2012 DA - 2012// TI - Variability in blood-based amyloid-beta assays: the need for consensus on pre-analytical processing JO - J Alzheimers Dis VL - 30 ID - Watt2012 ER - TY - JOUR AU - Braga, F. AU - Panteghini, M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Biologic variability of C-reactive protein: is the available information reliable? JO - Clin Chim Acta VL - 413 UR - https://doi.org/10.1016/j.cca.2012.04.010 DO - 10.1016/j.cca.2012.04.010 ID - Braga2012 ER - TY - JOUR AU - Lee, R. AU - Antonopoulos, A. S. AU - Alexopoulou, Z. AU - Margaritis, M. AU - Kharbanda, R. K. AU - Choudhury, R. P. AU - Antoniades, C. AU - Channon, K. M. PY - 2013 DA - 2013// TI - Artifactual elevation of plasma sCD40L by residual platelets in patients with coronary artery disease JO - Int J Cardiol VL - 168 UR - https://doi.org/10.1016/j.ijcard.2013.03.019 DO - 10.1016/j.ijcard.2013.03.019 ID - Lee2013 ER - TY - JOUR AU - West-Nørager, M. AU - Kelstrup, C. D. AU - Schou, C. AU - Høgdall, E. V. AU - Høgdall, C. K. AU - Heegaard, N. H. H. PY - 2007 DA - 2007// TI - Unravelling in vitro variables of major importance for the outcome of mass spectrometry-based serum proteomics JO - J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci VL - 847 UR - https://doi.org/10.1016/j.jchromb.2006.09.048 DO - 10.1016/j.jchromb.2006.09.048 ID - West-Nørager2007 ER - TY - JOUR AU - Villanueva, J. AU - Philip, J. AU - Chaparro, C. A. AU - Li, Y. AU - Toledo-Crow, R. AU - DeNoyer, L. AU - Fleisher, M. AU - Robbins, R. J. AU - Tempst, P. PY - 2005 DA - 2005// TI - Correcting common errors in identifying cancer-specific serum peptide signatures JO - J Proteome Res VL - 4 UR - https://doi.org/10.1021/pr050034b DO - 10.1021/pr050034b ID - Villanueva2005 ER - TY - JOUR AU - Li, X. -. J. AU - Lee, L. W. AU - Hayward, C. AU - Brusniak, M. -. Y. AU - Fong, P. -. Y. AU - McLean, M. AU - Mulligan, J. AU - Spicer, D. AU - Fang, K. C. AU - Hunsucker, S. W. AU - Kearney, P. PY - 2015 DA - 2015// TI - An integrated quantification method to increase the precision, robustness, and resolution of protein measurement in human plasma samples JO - Clin Proteomics VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/1559-0275-12-3 DO - 10.1186/1559-0275-12-3 ID - Li2015 ER - TY - JOUR AU - Karczmarski, J. AU - Rubel, T. AU - Mikula, M. AU - Wolski, J. AU - Rutkowski, A. AU - Zagorowicz, E. AU - Dadlez, M. AU - Ostrowski, J. PY - 2013 DA - 2013// TI - Pre-analytical-related variability influencing serum peptide profiles demonstrated in a mass spectrometry-based search for colorectal and prostate cancer biomarkers JO - Acta Biochim Pol VL - 60 ID - Karczmarski2013 ER - TY - JOUR AU - Banks, R. E. AU - Stanley, A. J. AU - Cairns, D. A. AU - Barrett, J. H. AU - Clarke, P. AU - Thompson, D. AU - Selby, P. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Influences of blood sample processing on low-molecular-weight proteome identified by surface-enhanced laser desorption/ionization mass spectrometry JO - Clin Chem VL - 51 UR - https://doi.org/10.1373/clinchem.2005.051417 DO - 10.1373/clinchem.2005.051417 ID - Banks2005 ER - TY - JOUR AU - Timms, J. F. AU - Arslan-Low, E. AU - Gentry-Maharaj, A. AU - Luo, Z. AU - T’Jampens, D. AU - Podust, V. N. AU - Ford, J. AU - Fung, E. T. AU - Gammerman, A. AU - Jacobs, I. AU - Menon, U. PY - 2007 DA - 2007// TI - Preanalytic influence of sample handling on SELDI-TOF serum protein profiles JO - Clin Chem VL - 53 UR - https://doi.org/10.1373/clinchem.2006.080101 DO - 10.1373/clinchem.2006.080101 ID - Timms2007 ER - TY - JOUR AU - Kaisar, M. AU - Dullemen, L. F. A. AU - Thézénas, M. L. AU - Charles, P. D. AU - Pleog, R. J. AU - Kessler, B. M. PY - 2016 DA - 2016// TI - Plasma biomarker profile altered through variable blood storage JO - Clin Chem VL - 62 UR - https://doi.org/10.1373/clinchem.2016.257246 DO - 10.1373/clinchem.2016.257246 ID - Kaisar2016 ER - TY - JOUR AU - Niessen, S. AU - Hoover, H. AU - Gale, A. J. PY - 2011 DA - 2011// TI - Proteomic analysis of the coagulation reaction in plasma and whole blood using PROTOMAP JO - Proteomics VL - 11 UR - https://doi.org/10.1002/pmic.201000674 DO - 10.1002/pmic.201000674 ID - Niessen2011 ER - TY - STD TI - Taking blood samples from colleagues or students for research and teaching. http://www.admin.ox.ac.uk/uohs/policies-guidance/blood/. Accessed 12 Aug 2016. UR - http://www.admin.ox.ac.uk/uohs/policies-guidance/blood/ ID - ref20 ER - TY - JOUR AU - Fischer, R. AU - Kessler, B. M. PY - 2015 DA - 2015// TI - Gel-aided sample preparation (GASP)—a simplified method for gel-assisted proteomic sample generation from protein extracts and intact cells JO - Proteomics VL - 15 UR - https://doi.org/10.1002/pmic.201400436 DO - 10.1002/pmic.201400436 ID - Fischer2015 ER - TY - JOUR AU - Dix, M. M. AU - Simon, G. M. AU - Cravatt, B. F. PY - 2008 DA - 2008// TI - Global mapping of the topography and magnitude of proteolytic events in apoptosis JO - Cell VL - 134 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2008.06.038 DO - 10.1016/j.cell.2008.06.038 ID - Dix2008 ER - TY - JOUR AU - Thézénas, M. L. AU - Huang, H. AU - Njie, M. AU - Ramaprasad, A. AU - Nwakanma, D. C. AU - Fischer, R. AU - Digleria, K. AU - Walther, M. AU - Conway, D. J. AU - Kessler, B. M. AU - Casals-Pascual, C. PY - 2013 DA - 2013// TI - PfHPRT: a new biomarker candidate of acute plasmodium falciparum infection JO - J Proteome Res VL - 12 UR - https://doi.org/10.1021/pr300858g DO - 10.1021/pr300858g ID - Thézénas2013 ER - TY - JOUR AU - Fischer, R. AU - Trudgian, D. C. AU - Wright, C. AU - Thomas, G. AU - Bradbury, L. A. AU - Brown, M. A. AU - Bowness, P. AU - Kessler, B. M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Discovery of candidate serum proteomic and metabolomic biomarkers in ankylosing spondylitis JO - Mol Cell Proteomics VL - 11 ID - Fischer2012 ER - TY - JOUR AU - Kessner, D. AU - Chambers, M. AU - Burke, R. AU - Agus, D. AU - Mallick, P. PY - 2008 DA - 2008// TI - ProteoWizard: open source software for rapid proteomics tools development JO - Bioinformatics VL - 24 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btn323 DO - 10.1093/bioinformatics/btn323 ID - Kessner2008 ER - TY - JOUR AU - Andoh, A. AU - Fujiyama, Y. AU - Kimura, T. AU - Uchihara, H. AU - Sakumoto, H. AU - Okabe, H. AU - Bamba, T. PY - 1997 DA - 1997// TI - Molecular characterization of complement components (C3, C4, and factor B) in human saliva JO - J Clin Immunol VL - 17 UR - https://doi.org/10.1023/A:1027320425291 DO - 10.1023/A:1027320425291 ID - Andoh1997 ER - TY - STD TI - Aguilar-Mahecha A, Kuzyk MA, Domanski D, Borchers CH, Basik M. The effect of pre-analytical variability on the measurement of MRM-MS-based mid- to high-abundance plasma protein biomarkers and a panel of cytokines. PLoS One 2012;7:e38290. ID - ref27 ER - TY - JOUR AU - Zhu, P. AU - Bowden, P. AU - Zhang, D. AU - Marshall, J. G. PY - 2011 DA - 2011// TI - Mass spectrometry of peptides and proteins from human blood JO - Mass Spectrom Rev VL - 30 ID - Zhu2011 ER - TY - JOUR AU - Sigdel, T. K. AU - Klassen, R. B. AU - Sarwal, M. M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Interpreting the proteome and peptidome in transplantation JO - Adv Clin Chem VL - 47 UR - https://doi.org/10.1016/S0065-2423(09)47006-9 DO - 10.1016/S0065-2423(09)47006-9 ID - Sigdel2009 ER - TY - JOUR AU - Li, Y. Y. AU - Li, Y. Y. AU - Chen, T. AU - Kuklina, A. S. AU - Bernard, P. AU - Esteva, F. J. AU - Shen, H. AU - Ferrari, M. AU - Hu, Y. PY - 2014 DA - 2014// TI - Circulating proteolytic products of carboxypeptidase N for early detection of breast cancer JO - Clin Chem VL - 60 UR - https://doi.org/10.1373/clinchem.2013.211953 DO - 10.1373/clinchem.2013.211953 ID - Li2014 ER - TY - JOUR AU - Merchant, M. L. AU - Niewczas, M. A. AU - Ficociello, L. H. AU - Lukenbill, J. A. AU - Wilkey, D. W. AU - Li, M. AU - Khundmiri, S. J. AU - Warram, J. H. AU - Krolewski, A. S. AU - Klein, J. B. PY - 2013 DA - 2013// TI - Plasma kininogen and kininogen fragments are biomarkers of progressive renal decline in type 1 diabetes JO - Kidney Int VL - 83 UR - https://doi.org/10.1038/ki.2013.8 DO - 10.1038/ki.2013.8 ID - Merchant2013 ER - TY - JOUR AU - Mullen, W. AU - Delles, C. AU - Mischak, H. PY - 2011 DA - 2011// TI - Urinary proteomics in the assessment of chronic kidney disease JO - Curr Opin Nephrol Hypertens VL - 20 UR - https://doi.org/10.1097/MNH.0b013e32834b7ffa DO - 10.1097/MNH.0b013e32834b7ffa ID - Mullen2011 ER - TY - JOUR AU - Starlinger, P. AU - Moll, H. P. AU - Assinger, A. AU - Nemeth, C. AU - Hoetzenecker, K. AU - Gruenberger, B. AU - Gruenberger, T. AU - Kuehrer, I. AU - Schoppmann, S. F. AU - Gnant, M. AU - Brostjan, C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Thrombospondin-1: a unique marker to identify in vitro platelet activation when monitoring in vivo processes JO - J Thromb Haemost VL - 8 UR - https://doi.org/10.1111/j.1538-7836.2010.03908.x DO - 10.1111/j.1538-7836.2010.03908.x ID - Starlinger2010 ER - TY - JOUR AU - Lee, N. V. AU - Sato, M. AU - Annis, D. S. AU - Loo, J. A. AU - Wu, L. AU - Mosher, D. F. AU - Iruela-Arispe, M. L. PY - 2006 DA - 2006// TI - ADAMTS1 mediates the release of antiangiogenic polypeptides from TSP1 and 2 JO - EMBO J VL - 25 UR - https://doi.org/10.1038/sj.emboj.7601400 DO - 10.1038/sj.emboj.7601400 ID - Lee2006 ER - TY - JOUR AU - Dardik, R. AU - Lahav, J. PY - 1999 DA - 1999// TI - Functional changes in the conformation of thrombospondin-1 during complexation with fibronectin or heparin JO - Exp Cell Res VL - 248 UR - https://doi.org/10.1006/excr.1999.4415 DO - 10.1006/excr.1999.4415 ID - Dardik1999 ER - TY - JOUR AU - Tan, K. AU - Duquette, M. AU - Liu, J. -. H. AU - Zhang, R. AU - Joachimiak, A. AU - Wang, J. AU - Lawler, J. PY - 2006 DA - 2006// TI - The structures of the thrombospondin-1 N-terminal domain and its complex with a synthetic pentameric heparin JO - Structure VL - 14 UR - https://doi.org/10.1016/j.str.2005.09.017 DO - 10.1016/j.str.2005.09.017 ID - Tan2006 ER - TY - JOUR AU - Damas, C. AU - Vink, T. AU - Nieuwenhuis, H. K. AU - Sixma, J. J. PY - 2001 DA - 2001// TI - The 33-kDa platelet alpha-granule membrane protein (GMP-33) is an N-terminal proteolytic fragment of thrombospondin JO - Thromb Haemost VL - 86 ID - Damas2001 ER - TY - JOUR AU - Bonnefoy, A. AU - Legrand, C. PY - 2000 DA - 2000// TI - Proteolysis of subendothelial adhesive glycoproteins (fibronectin, thrombospondin, and von Willebrand factor) by plasmin, leukocyte cathepsin G, and elastase JO - Thromb Res VL - 98 UR - https://doi.org/10.1016/S0049-3848(99)00242-X DO - 10.1016/S0049-3848(99)00242-X ID - Bonnefoy2000 ER - TY - JOUR AU - Resovi, A. AU - Pinessi, D. AU - Chiorino, G. AU - Taraboletti, G. PY - 2014 DA - 2014// TI - Current understanding of the thrombospondin-1 interactome JO - Matrix Biol VL - 37 UR - https://doi.org/10.1016/j.matbio.2014.01.012 DO - 10.1016/j.matbio.2014.01.012 ID - Resovi2014 ER - TY - JOUR AU - Jeanne, A. AU - Schneider, C. AU - Martiny, L. AU - Dedieu, S. PY - 2015 DA - 2015// TI - Original insights on thrombospondin-1-related antireceptor strategies in cancer JO - Front Pharmacol VL - 6 UR - https://doi.org/10.3389/fphar.2015.00252 DO - 10.3389/fphar.2015.00252 ID - Jeanne2015 ER - TY - JOUR AU - Conde, I. PY - 2005 DA - 2005// TI - Platelet activation leads to activation and propagation of the complement system JO - J Exp Med VL - 201 UR - https://doi.org/10.1084/jem.20041497 DO - 10.1084/jem.20041497 ID - Conde2005 ER -