Table 2 Results from the various proteotyping techniques utilized in this work compared to genomic sequencing
Patient # | Intact Protein Deconvolution | Intact Protein Chromatogram | Peptide | Genomic Sequencing |
|---|---|---|---|---|
1 | E3/E4 | E3/E4 | E3/E4 | E3/E4 |
2 | E3/E4 | E3/E4 | E3/E4 | E3/E4 |
3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
4 | E3/E4 | E3/E4 | E3/E4 | E3/E4 |
5 | E3/E3* | E3/E3* | E3/E3* | E3/E4* |
6 | E3/E4 | E3/E4 | E3/E4 | E3/E4 |
7 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
8 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
9 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
10 | E3/E4 | E3/E4 | E3/E4 | E3/E4 |
11 | E2/E3 | E2/E3 | E2/E3 | E2/E3 |
12 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | Unable Seq* |
13 | E3/E4 | E3/E4 | E3/E4 | Unable Seq* |
14 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
15 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
16 | E2/E4 | E2/E4 | E2/E4 | E2/E4 |
17 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
18 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
19 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
20 | E3/E4 | E3/E4 | E3/E4 | E3/E4 |
21 | E2/E3 | E2/E3 | E2/E3 | E2/E3 |
22 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
23 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
24 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
25 | E3/E4 | E3/E4 | E3/E4 | E3/E4 |
26 | E2/E3 | E2/E3 | E2/E3 | E2/E3 |
27 | E2/E3 | E2/E3 | E2/E3 | E2/E3 |
28 | E2/E3 | E2/E3 | E2/E3 | E2/E3 |
29 | E4/E4 | E4/E4 | E4/E4 | Unable Seq* |
30 | E2/E3 | E2/E3 | E2/E3 | E2/E3 |
31 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
32 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
33 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
34 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
35 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
36 | E2/E4 | E2/E4 | E2/E4 | E2/E4 |
37 | E4/E4 | E4/E4 | E4/E4 | E4/E4 |
38 | E2/E4 | E4/E4* | E2/E4 | E2/E4 |
39 | E4/E4 | E4/E4 | E4/E4 | E4/E4 |
40 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 | E3/E3 |
41 | E3/E3* | E3/E3* | E3/E4 | E3/E4 |